24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2562 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  77.65 
 
 		 449 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  77.41 
 
 		 449 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  99.06 
 
 		 455 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  77.41 
 
 		 449 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2688  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.56 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2561  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.89 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.58 
 
 		 897 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 337 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  36.21 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  36.76 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  36.76 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  35.59 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.67 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  36.76 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  36.76 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  41.67 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>