106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2595 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 336 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  91.37 
 
 		 336 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  91.67 
 
 		 336 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  90.18 
 
 		 336 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  79.82 
 
 		 337 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  76.33 
 
 		 338 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  75.74 
 
 		 338 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  76.04 
 
 		 338 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  75.15 
 
 		 338 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  62.2 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  60.13 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  63.8 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  55.43 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  56.82 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  53.43 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  36.6 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  36.31 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.37 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  35.76 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.95 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  39.36 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  35.37 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.34 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  37.01 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  37.37 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  35.37 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  31.63 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  32.11 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  29.97 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.95 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  28.73 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.33 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.36 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  29.38 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  29.32 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.27 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  28.4 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.91 
 
 		 324 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  27.34 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  27.17 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.34 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  29.75 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.15 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.82 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.82 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.6 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  26.39 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.14 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.43 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.6 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.41 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.39 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 397 aa  92.4  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  25.15 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.79 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  21.31 
 
 		 897 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  27.07 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  29.08 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  25.26 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  22.74 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.92 
 
 		 661 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  24.06 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  34.21 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  30.67 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  30.67 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  26.12 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.58 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 421 aa  52.8  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 340 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  27.32 
 
 		 742 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  23.47 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  21.69 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.65 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  24.03 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  31.97 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.31 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  32.8 
 
 		 338 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  24.01 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  23.26 
 
 		 931 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  23.67 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.51 
 
 		 1527 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  28.23 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  25.51 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  38.81 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  31.63 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  30 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  30.67 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  27.78 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  21.82 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  29.73 
 
 		 759 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  28.97 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  21.3 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.19 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>