95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6866 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  100 
 
 
354 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.79 
 
 
352 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  46.73 
 
 
356 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  45.54 
 
 
356 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  47.99 
 
 
368 aa  262  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  45.67 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  45.3 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  43.41 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  41.86 
 
 
331 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  43.21 
 
 
363 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.54 
 
 
359 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  35.99 
 
 
382 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  42.25 
 
 
353 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.4 
 
 
342 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  33.23 
 
 
363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.42 
 
 
365 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  33.86 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  34.37 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  33.45 
 
 
340 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  33.54 
 
 
319 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  33.54 
 
 
346 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  34.81 
 
 
341 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.3 
 
 
369 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  34.74 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.64 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.55 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.92 
 
 
324 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.56 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  34.64 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  28.99 
 
 
336 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.37 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  29.47 
 
 
344 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  31.07 
 
 
321 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  26.63 
 
 
337 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.9 
 
 
322 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.9 
 
 
322 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.65 
 
 
323 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.65 
 
 
323 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.76 
 
 
359 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.51 
 
 
322 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  27.68 
 
 
336 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  26.36 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  27.35 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  27.35 
 
 
338 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  25.37 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  25.82 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  25.82 
 
 
336 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  27.35 
 
 
338 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  25.75 
 
 
341 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  27.35 
 
 
338 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.79 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  25.97 
 
 
397 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  32.21 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  26.36 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  26.4 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  26.08 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  25.13 
 
 
335 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.36 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.52 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.37 
 
 
897 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  28.53 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.82 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.39 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.28 
 
 
336 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.64 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  27.78 
 
 
315 aa  56.2  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.95 
 
 
371 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28.11 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.49 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  24.72 
 
 
931 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  47.76 
 
 
366 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.98 
 
 
661 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  26.45 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.85 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  24.78 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25.08 
 
 
742 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  28.33 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  26.32 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  26.32 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  22.86 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
759 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  24.52 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  27.71 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.73 
 
 
630 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  26.51 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  20.78 
 
 
698 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  26.09 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  22 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  28.35 
 
 
1140 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  27.12 
 
 
408 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  30 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  22.52 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>