91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0646 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.33 
 
 
352 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  46.48 
 
 
354 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  43.28 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.99 
 
 
356 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  41.62 
 
 
368 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  43.58 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  38.66 
 
 
331 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  39.87 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  36.02 
 
 
331 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.33 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.93 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  34.04 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  35.42 
 
 
340 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  33.77 
 
 
382 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  34.34 
 
 
361 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  38.95 
 
 
341 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.25 
 
 
369 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  36.49 
 
 
342 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  38.55 
 
 
346 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  38.55 
 
 
319 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.12 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  30.57 
 
 
361 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  37.91 
 
 
353 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  38.78 
 
 
343 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.64 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  33.79 
 
 
324 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  30.09 
 
 
336 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  28.65 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  28.41 
 
 
337 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  27.98 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  34.23 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  27.98 
 
 
338 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.57 
 
 
299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  30.19 
 
 
344 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  27.98 
 
 
338 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  31.77 
 
 
321 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  29.2 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  27.42 
 
 
336 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  27.72 
 
 
338 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  27.68 
 
 
336 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  27.68 
 
 
336 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  31.4 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.63 
 
 
314 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  26.59 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.58 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.09 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  28.22 
 
 
338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  26.44 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  32.77 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  24.77 
 
 
341 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  29.93 
 
 
323 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.93 
 
 
323 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.85 
 
 
322 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  25.23 
 
 
337 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.85 
 
 
322 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.85 
 
 
322 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.06 
 
 
334 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  26.09 
 
 
397 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  28.31 
 
 
897 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  28.73 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.96 
 
 
661 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.95 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  25.57 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.64 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  24.9 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  23.44 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.02 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.22 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  37.33 
 
 
3794 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.58 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  28.57 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  28.57 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.13 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  27.3 
 
 
931 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.39 
 
 
2082 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  24.28 
 
 
3320 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  24.61 
 
 
698 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  36 
 
 
313 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  31.97 
 
 
742 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  27.56 
 
 
421 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  27 
 
 
1120 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  36.51 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  27.68 
 
 
759 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  26.1 
 
 
1140 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  28.57 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  22.22 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  21.22 
 
 
337 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  24.83 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>