90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4061 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  100 
 
 		 356 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  92.81 
 
 		 356 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  94.89 
 
 		 355 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  51.62 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  45.7 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  43.27 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  46.11 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  47.59 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  42.66 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  48.29 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  38.04 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.57 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  36.89 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.5 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  39.02 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.72 
 
 		 365 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  43.15 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  38.91 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  40.82 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  41.32 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  36.73 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  40.27 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.84 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.37 
 
 		 324 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  35.85 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  32.25 
 
 		 359 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 344 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  39.38 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  37.64 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.62 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  33.86 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.34 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  34.34 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  33.64 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.65 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.39 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  34.71 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  36.23 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.51 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.15 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.15 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.84 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 336 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 338 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  25.97 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.53 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.34 
 
 		 897 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  27.34 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  29.12 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.68 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.72 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  28.62 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  30.03 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  27.4 
 
 		 931 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.09 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  34.87 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  23.68 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.27 
 
 		 698 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  44.71 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_013526  Tter_2469  hypothetical protein  31.35 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.92673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  25.41 
 
 		 614 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.83 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  28.2 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1140 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0852  hypothetical protein  26 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 2082 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  24.19 
 
 		 759 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.82 
 
 		 449 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.82 
 
 		 449 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40.82 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.9 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.28 
 
 		 652 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  39.58 
 
 		 455 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  39.58 
 
 		 425 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>