81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1178 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  100 
 
 		 349 aa  699    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  57.78 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  56.55 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  56.55 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  55.52 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  54.75 
 
 		 339 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  54.37 
 
 		 333 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  52.73 
 
 		 340 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  47.76 
 
 		 333 aa  308  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  48.56 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  42.31 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  46.65 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  40.83 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  43.67 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  43.67 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  40.83 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  40.96 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  40.53 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  40.06 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  41.5 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  25 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.58 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  31.14 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  27.27 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  28.92 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.55 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.27 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  30.6 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.77 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.77 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.7 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  34.85 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  32.89 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.06 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  37.75 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.14 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  25.29 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.17 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  28.82 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.22 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.99 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.99 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  26.25 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  27.93 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.21 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.14 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  28.49 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  28.5 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.63 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  31.62 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.47 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.46 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  26.45 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  30.26 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.27 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  29.27 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  28.57 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  26.77 
 
 		 1120 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  34.31 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  27.17 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  26.51 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.92 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  21.83 
 
 		 742 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 759 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.87 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0422  hypothetical protein  22.45 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.326988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>