69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03291 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  100 
 
 
337 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  81.31 
 
 
338 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  80.71 
 
 
338 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  78.64 
 
 
338 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  58.28 
 
 
338 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  57.99 
 
 
338 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  58.79 
 
 
339 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  56.29 
 
 
335 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  52.68 
 
 
333 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  54.14 
 
 
333 aa  348  9e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  41.08 
 
 
349 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  39.88 
 
 
333 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  36.28 
 
 
337 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  37.28 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  37.28 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  37.99 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.58 
 
 
340 aa  238  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  35.8 
 
 
334 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  33.33 
 
 
363 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  31.75 
 
 
408 aa  179  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  19.65 
 
 
897 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  28.93 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  25.7 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  28.74 
 
 
361 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.88 
 
 
323 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.99 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  28.02 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.99 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.59 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.85 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.35 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  25.14 
 
 
341 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.27 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  26.71 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  26.92 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  26.92 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  22.83 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  23.66 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.02 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  34.94 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.14 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.14 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  27.64 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  25.47 
 
 
368 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  32.47 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  28.8 
 
 
1120 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.89 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.93 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  26.67 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.89 
 
 
352 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.47 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  23.89 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  25 
 
 
332 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  22.81 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  23.28 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.9 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  30.1 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  28.71 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  27.62 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  23.93 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.96 
 
 
321 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  28.1 
 
 
742 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  35 
 
 
324 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.05 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.53 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  23.02 
 
 
614 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>