18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4449 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4449  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  831    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  29.52 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  29.52 
 
 
336 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  36.92 
 
 
336 aa  49.7  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  31.71 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  31.25 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  33.85 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  31.03 
 
 
339 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.48 
 
 
325 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  29.85 
 
 
334 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  33.85 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.17 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  26.45 
 
 
344 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  32.35 
 
 
313 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  28.57 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>