238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0949 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0949  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 		 537 aa  1066    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2017  Uracil DNA glycosylase-like protein  40.99 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  29.47 
 
 		 225 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  27.8 
 
 		 233 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.73 
 
 		 234 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  26.94 
 
 		 231 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  24.2 
 
 		 228 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 		 234 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.28 
 
 		 234 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.83 
 
 		 234 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.31 
 
 		 229 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  25.57 
 
 		 225 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  24.49 
 
 		 224 aa  88.6  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  27.85 
 
 		 225 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0151  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.22 
 
 		 257 aa  87.4  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818415 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  31.22 
 
 		 222 aa  87  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  27.44 
 
 		 225 aa  87  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  28.78 
 
 		 234 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  26.51 
 
 		 223 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  25.85 
 
 		 226 aa  86.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  25.58 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  27.8 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  26.34 
 
 		 238 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  27.8 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  27.8 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0138  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.78 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0590292  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  29.41 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  29.85 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  25.87 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  29.07 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  29.15 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  25.58 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  27.4 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  26.77 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  29.07 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  30 
 
 		 221 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  26.18 
 
 		 227 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  32.2 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  29.75 
 
 		 226 aa  83.2  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  29.65 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  24.55 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  30.22 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  30.58 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  25.84 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  26.92 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  25.81 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  26.99 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  30.84 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  26.32 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  29.3 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  25 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  29.95 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  26.03 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  29.21 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  30.17 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  24.26 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  30.54 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf815  uracil-DNA glycosylase  32.06 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  31.43 
 
 		 225 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  27.4 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2594  Uracil-DNA glycosylase  28.17 
 
 		 233 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.744963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  31.4 
 
 		 234 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  25.71 
 
 		 225 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  27.4 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  27.31 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  26.54 
 
 		 279 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  26.61 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  28.89 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  35.1 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  27.16 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  27.16 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  35.6 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  26.72 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  30.85 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  30.77 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  30 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  25.35 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  28.63 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  29.08 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  26.74 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  28.17 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  28.63 
 
 		 231 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  28.44 
 
 		 217 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  25.76 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  29.41 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  28.77 
 
 		 255 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  30.36 
 
 		 232 aa  76.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  31 
 
 		 230 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  31.63 
 
 		 225 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  31.63 
 
 		 225 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  29.8 
 
 		 211 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  27.13 
 
 		 225 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  28.1 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  28.1 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  25.52 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  28.1 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  28.63 
 
 		 231 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  23.89 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  26.72 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  28.1 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>