237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2944 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  76.21 
 
 
227 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  75.11 
 
 
224 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  67.42 
 
 
238 aa  315  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  69.64 
 
 
225 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  69.23 
 
 
225 aa  310  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  66.96 
 
 
225 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  70.09 
 
 
231 aa  309  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  68.33 
 
 
225 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  67.26 
 
 
227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  67.26 
 
 
227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  67.41 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  67.26 
 
 
227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  68.18 
 
 
233 aa  304  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  69.09 
 
 
229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  70.37 
 
 
230 aa  300  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  66.97 
 
 
225 aa  300  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  66.97 
 
 
228 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 
225 aa  297  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  66.06 
 
 
224 aa  296  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  66.36 
 
 
223 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  68.14 
 
 
227 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  67.27 
 
 
259 aa  280  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  66.36 
 
 
230 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  60.7 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  63.85 
 
 
213 aa  270  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  58.41 
 
 
238 aa  264  8.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  61.93 
 
 
225 aa  256  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.91 
 
 
240 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  60.35 
 
 
263 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  59.24 
 
 
234 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  51.28 
 
 
232 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 
232 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
229 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 
225 aa  187  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  44.95 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  49.27 
 
 
268 aa  182  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 
229 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 
225 aa  181  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 
225 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 
225 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 
233 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 
225 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  43.36 
 
 
225 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
231 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 
226 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  44.25 
 
 
225 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
231 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  43.36 
 
 
225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  44.25 
 
 
225 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 
226 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 
224 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
230 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 
226 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 
241 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  43.61 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
235 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  42.27 
 
 
244 aa  172  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  50.99 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
241 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 
226 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  43.2 
 
 
226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 
228 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 
221 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  41.2 
 
 
231 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
233 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
237 aa  167  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 
228 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
230 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 
222 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  40.91 
 
 
223 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 
228 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  45.63 
 
 
229 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  44.49 
 
 
227 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  42.52 
 
 
216 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  49.21 
 
 
234 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
253 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
219 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
253 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  41.28 
 
 
222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  47.83 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>