237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0728 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
238 aa  477  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  77.33 
 
 
225 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  74.67 
 
 
225 aa  358  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  74.22 
 
 
225 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  71.81 
 
 
228 aa  348  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  70.98 
 
 
224 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  69.33 
 
 
225 aa  337  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  69.16 
 
 
227 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  69.16 
 
 
227 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  69.16 
 
 
227 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  73.64 
 
 
233 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  69.96 
 
 
225 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  73.54 
 
 
225 aa  332  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  71.56 
 
 
231 aa  328  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  73.13 
 
 
227 aa  321  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  68.78 
 
 
227 aa  318  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  67.42 
 
 
226 aa  315  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 
229 aa  310  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  67.57 
 
 
225 aa  310  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  67.27 
 
 
223 aa  308  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  66.21 
 
 
229 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 
224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  64.22 
 
 
230 aa  298  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  66.22 
 
 
230 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  65.73 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  59.56 
 
 
259 aa  275  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  57.14 
 
 
238 aa  269  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  61.64 
 
 
225 aa  262  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  58.87 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  61.23 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.98 
 
 
240 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  49.14 
 
 
232 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  45.05 
 
 
232 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  45.13 
 
 
229 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  39.38 
 
 
225 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 
218 aa  181  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  39.38 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 
225 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  43.38 
 
 
269 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 
229 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 
225 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  38.94 
 
 
225 aa  177  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
225 aa  177  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
229 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  38.94 
 
 
225 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  39.38 
 
 
225 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 
224 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  43.05 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  44.9 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  38.94 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  45.73 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  41.7 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  41.44 
 
 
231 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 
261 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 
222 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 
226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  41.44 
 
 
230 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  41.44 
 
 
231 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  44.72 
 
 
225 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  43.5 
 
 
226 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  45.26 
 
 
225 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  39.47 
 
 
244 aa  169  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 
233 aa  168  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
230 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 
231 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  41.52 
 
 
229 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 
279 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 
224 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
230 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 
234 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
228 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  41.35 
 
 
241 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 
230 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  40.27 
 
 
235 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 
243 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
259 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
259 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
259 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
271 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  43.28 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  40.37 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  40.27 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  42.44 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 
304 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>