238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 259 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  67.27 
 
 		 226 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  59.56 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  68.18 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  63.96 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  61.71 
 
 		 225 aa  271  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  60.36 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  63.64 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  64.09 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  59.01 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  63.26 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  58.87 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  61.09 
 
 		 225 aa  258  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  61.71 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  61.61 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  61.61 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  61.61 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.66 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  61.4 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  58.64 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  59.65 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  61.57 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 238 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  61.57 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  59.07 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.53 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  61.71 
 
 		 263 aa  234  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  61.32 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  58.93 
 
 		 227 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  54.76 
 
 		 213 aa  224  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  51.43 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 225 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  42.34 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  42.34 
 
 		 225 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  48.06 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  43.32 
 
 		 225 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  43.62 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45.81 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  46.5 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  42.49 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  41.95 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  40.64 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  46.23 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44.19 
 
 		 226 aa  168  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 231 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  41.38 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  50.52 
 
 		 245 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  51.83 
 
 		 222 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  42.93 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  44.12 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  49.74 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  47.28 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  41.89 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  49.21 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0474  uracil-DNA glycosylase  34.39 
 
 		 218 aa  159  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  45.18 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  40.62 
 
 		 223 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  47.59 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  45.81 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  48.44 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.92 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  44.16 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  44.68 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  44.68 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 		 221 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  46.07 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  44.68 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.63 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>