238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  78.22 
 
 		 225 aa  364  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  74.22 
 
 		 238 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  73.33 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  74.32 
 
 		 228 aa  348  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  70.4 
 
 		 224 aa  333  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 233 aa  332  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  71.11 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  70.04 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  70.04 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  70.04 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  68.89 
 
 		 225 aa  328  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 		 231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  68.89 
 
 		 225 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  67.41 
 
 		 227 aa  320  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  67.87 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 224 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  72.69 
 
 		 227 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  66.96 
 
 		 226 aa  310  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  69.19 
 
 		 230 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  65.91 
 
 		 223 aa  298  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  67.44 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  67.74 
 
 		 230 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 225 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  59.47 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  65.24 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  59.01 
 
 		 259 aa  263  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  62.84 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.07 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  58.01 
 
 		 234 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  55.84 
 
 		 263 aa  240  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  52.81 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  46.79 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 229 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.11 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  46.33 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  46.4 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  53.53 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  45.25 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  47.76 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  47.76 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  49.75 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  46.23 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  46.53 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  50.75 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  51.44 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  44.75 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  42.6 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  44.67 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.05 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44.95 
 
 		 226 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  42.23 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  45.18 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  47.92 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  49.74 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  43.59 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>