238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3204 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  75.68 
 
 		 227 aa  338  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  73.3 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  74.66 
 
 		 231 aa  332  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  72.85 
 
 		 225 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  71.75 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  71.75 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  71.75 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  67.87 
 
 		 225 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  70.14 
 
 		 225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  68.3 
 
 		 228 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 238 aa  310  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  68.33 
 
 		 225 aa  308  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  70.27 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  69.09 
 
 		 226 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  73.54 
 
 		 227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  66.08 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 		 225 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  69.63 
 
 		 229 aa  291  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  65.45 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  65.44 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.99 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  63.06 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  62.91 
 
 		 213 aa  271  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  54.74 
 
 		 238 aa  261  6e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  60.65 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  59.65 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.14 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  58.06 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  57.96 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.66 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 231 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  48.66 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  42.41 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  42.41 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  46.64 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  41.96 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  41.96 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  41.96 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  45.15 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  44.17 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.71 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  50.29 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  41.52 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  40.17 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  42.66 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  50.3 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  43.69 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  46.41 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.69 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.32 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 226 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.06 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  43.36 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  47.74 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  46.83 
 
 		 227 aa  161  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  44.95 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  47.57 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  44.17 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  41.95 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  43.43 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>