240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4002 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 230 aa  460  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  70.37 
 
 		 223 aa  304  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  66.22 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  67.74 
 
 		 225 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  66.22 
 
 		 225 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  67.12 
 
 		 224 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  64.16 
 
 		 230 aa  284  8e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  64.44 
 
 		 225 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  67.45 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  66.36 
 
 		 227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  66.36 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  64 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  64.52 
 
 		 225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  63.47 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  66.04 
 
 		 231 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  61.75 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.79 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  61.64 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  56.76 
 
 		 238 aa  255  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  60.65 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  61.09 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  61.57 
 
 		 259 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  60.55 
 
 		 225 aa  244  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  61.67 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  60.54 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  63.23 
 
 		 234 aa  238  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  57.28 
 
 		 213 aa  234  9e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.28 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  48.67 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  45.18 
 
 		 269 aa  192  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  44.14 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  45.09 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  47.21 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  47.55 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  47.26 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  42.36 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.49 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  46.31 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  46.4 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 		 247 aa  175  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  45.59 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  44.6 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  44.6 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  43.12 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  43.12 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  44.6 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  44.28 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  47.98 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  46.79 
 
 		 226 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  43.19 
 
 		 221 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.09 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  48.44 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 226 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  43.78 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  46.85 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  47.27 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  42.15 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  44.02 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  47.6 
 
 		 261 aa  167  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  46.27 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  46.39 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  39.39 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  41.28 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  42.72 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>