240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3091 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  66.67 
 
 		 221 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  68.98 
 
 		 219 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  66.67 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  66.06 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  65.74 
 
 		 221 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  65.74 
 
 		 221 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  65.28 
 
 		 221 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  65.28 
 
 		 221 aa  314  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  66.2 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  65.32 
 
 		 222 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  65.6 
 
 		 221 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  65.74 
 
 		 219 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  62.84 
 
 		 222 aa  304  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  63.43 
 
 		 218 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  61.57 
 
 		 221 aa  289  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  59.72 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  60.65 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  61.86 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  61.21 
 
 		 228 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  59.72 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  60.75 
 
 		 228 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  59.81 
 
 		 228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  60.28 
 
 		 227 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  58.72 
 
 		 224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  59.35 
 
 		 228 aa  271  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  58.82 
 
 		 221 aa  270  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 		 228 aa  264  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  57.94 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  57.94 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  56.94 
 
 		 225 aa  258  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  57.01 
 
 		 229 aa  257  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 		 222 aa  257  1e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  56.02 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 		 229 aa  251  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 243 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 261 aa  236  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  54.76 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.78 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 		 241 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 240 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 		 226 aa  228  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 223 aa  224  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 245 aa  224  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 230 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  48.61 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 		 301 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>