239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0774 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  75.21 
 
 		 263 aa  334  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  63.88 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  63.72 
 
 		 223 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  63.2 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  60.61 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  61.47 
 
 		 225 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  63.16 
 
 		 225 aa  277  8e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  61.23 
 
 		 238 aa  276  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  61.5 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  61.84 
 
 		 227 aa  272  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  61.47 
 
 		 231 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  63.23 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  59.31 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  58.01 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 		 226 aa  264  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  58.33 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  58.33 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  58.33 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.83 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  57.71 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  61.26 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  56.81 
 
 		 213 aa  248  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.37 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  57.96 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  61.82 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  59.17 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  58.8 
 
 		 227 aa  238  5e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.07 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.3 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  45.38 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  45.42 
 
 		 232 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  46.67 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  49.34 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  42.36 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  44.88 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  42.36 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  39.57 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.91 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  45.73 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  40.43 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.78 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  40.79 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  40.79 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  46.38 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.95 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  47.44 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  45.3 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  42.49 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  44.07 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 228 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  44.02 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.64 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  42.37 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  43.22 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.8 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  43.59 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  44.44 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  40.79 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.23 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  40.44 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  43.2 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  39.66 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  40.44 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  41.48 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  41.06 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  39.47 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  42.36 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>