240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1467 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
217 aa  274  9e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 
217 aa  259  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  56.36 
 
 
219 aa  247  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
229 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
235 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
269 aa  224  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
233 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
229 aa  219  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  51.17 
 
 
226 aa  218  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
224 aa  218  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  51.4 
 
 
233 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  52.09 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
225 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
247 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
268 aa  216  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 
223 aa  214  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
232 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  48.37 
 
 
222 aa  215  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.64 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  51.4 
 
 
230 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
231 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 
225 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 
223 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 
230 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
231 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  51.24 
 
 
243 aa  208  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
230 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
231 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
225 aa  207  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 
229 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  50.75 
 
 
218 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 
225 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  50.75 
 
 
218 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 
225 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 
225 aa  205  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 
225 aa  204  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  48.36 
 
 
240 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 
232 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
227 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  46.82 
 
 
261 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 
231 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
221 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 
241 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 
221 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 
221 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 
219 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 
245 aa  201  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  48.37 
 
 
230 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
216 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  47.44 
 
 
230 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  46.51 
 
 
225 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  48.29 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
237 aa  194  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 
221 aa  194  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 
229 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  48.29 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50.25 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 
226 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 
221 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 
225 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  43.84 
 
 
244 aa  192  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 
231 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 
235 aa  192  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  48.36 
 
 
221 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  44.6 
 
 
231 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 
226 aa  191  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 
231 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 
228 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 
228 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 
226 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 
234 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 
225 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 
222 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 
229 aa  189  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
225 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  41.28 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 
232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 
226 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  48.94 
 
 
211 aa  188  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  44.65 
 
 
216 aa  188  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
224 aa  188  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  44.13 
 
 
232 aa  188  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>