237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0228 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 216 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  82.87 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  82.87 
 
 		 218 aa  394  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  57.28 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  55.4 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  53.77 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  53.3 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  56.78 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  58.03 
 
 		 216 aa  241  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  54.93 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  54.67 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.83 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  57.29 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  57.29 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  53.77 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 		 224 aa  234  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  52.83 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  55.78 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  52.83 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  52.36 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  55.78 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  50.94 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  51.64 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  55.78 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  52.11 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 228 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  55.78 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  57.84 
 
 		 229 aa  227  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  52.5 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.73 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  51.89 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 228 aa  224  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  50.91 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  57.61 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.17 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  49.06 
 
 		 226 aa  222  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  53.37 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  48.58 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  48.15 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  52.58 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 240 aa  217  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.11 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  48.37 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.03 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  49.75 
 
 		 233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  48.5 
 
 		 235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  48.85 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  46.73 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  48.11 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  51.3 
 
 		 241 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  49.25 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  49.25 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 221 aa  211  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  51.5 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  46.48 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>