237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4601 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  76 
 
 		 225 aa  342  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  73.42 
 
 		 228 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  73.54 
 
 		 238 aa  332  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  71.11 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 		 225 aa  324  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  67.71 
 
 		 224 aa  318  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  70 
 
 		 233 aa  317  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 		 231 aa  310  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  65.64 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  65.64 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  65.64 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 226 aa  297  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  65.61 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 223 aa  294  7e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  64.44 
 
 		 225 aa  294  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 		 229 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  63.11 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  63.8 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  68.72 
 
 		 227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  65.16 
 
 		 225 aa  278  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  62.33 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  61.11 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  63.85 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  61.64 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  55.95 
 
 		 238 aa  254  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  58.64 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  60.55 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  56.22 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  54.98 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  44.78 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  44.8 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 268 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  42.2 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  40.45 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  42.41 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  43.5 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  43.63 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  37.78 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  41.96 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  42.41 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  37.78 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  38.22 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  41.52 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  38.22 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  45.13 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  37.33 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  41.52 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  38.22 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  40.62 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  38.22 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  43.61 
 
 		 271 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  38.53 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  38.22 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  40.91 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  48.52 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  40.62 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  37.78 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  37.78 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  41.12 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  37.44 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.19 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  43.17 
 
 		 271 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  39.29 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  39.55 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 		 304 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  41.26 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  43.86 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>