238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3561 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  99.62 
 
 
271 aa  530  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  98.09 
 
 
268 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  98.09 
 
 
259 aa  516  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  98.09 
 
 
259 aa  516  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  98.09 
 
 
259 aa  516  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  93.51 
 
 
271 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  78.65 
 
 
279 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  86.44 
 
 
301 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  83.74 
 
 
253 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  85.59 
 
 
308 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  85.59 
 
 
305 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  82 
 
 
304 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  85.59 
 
 
305 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  84.32 
 
 
304 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  84.75 
 
 
301 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2703  uracil-DNA glycosylase  80.53 
 
 
270 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  62.6 
 
 
263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  62.21 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  60.96 
 
 
256 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  60.47 
 
 
266 aa  292  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  61.72 
 
 
255 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 
226 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 
228 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  55.2 
 
 
223 aa  247  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  57.14 
 
 
230 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  56.7 
 
 
230 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  56.64 
 
 
228 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  63.32 
 
 
227 aa  244  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  54.87 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
226 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
231 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  52.81 
 
 
235 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  55.51 
 
 
231 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  57.59 
 
 
261 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
230 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.25 
 
 
228 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 
226 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  55.36 
 
 
233 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 
226 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 
233 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  54.91 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
230 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  52.27 
 
 
222 aa  234  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  56.81 
 
 
228 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  60.1 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 
224 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  59.62 
 
 
229 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  50.88 
 
 
225 aa  231  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  229  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
221 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  229  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  59.13 
 
 
229 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  56.31 
 
 
218 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  56.37 
 
 
229 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  51.05 
 
 
253 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  51.05 
 
 
253 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
225 aa  228  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
222 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 
229 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  55.12 
 
 
231 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.57 
 
 
230 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
240 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  56.52 
 
 
229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 
225 aa  224  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  58.5 
 
 
228 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  58.5 
 
 
228 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  53.08 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  58.5 
 
 
228 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  51.32 
 
 
241 aa  221  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
221 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 
229 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 
269 aa  219  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 
225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 
237 aa  218  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
221 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 
225 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
219 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
218 aa  218  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 
216 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 
225 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  49.32 
 
 
220 aa  217  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  48.64 
 
 
219 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>