240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4244 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  86.09 
 
 		 233 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  65.93 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  56.94 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  52.07 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 226 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  49.06 
 
 		 220 aa  228  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 225 aa  227  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  47.89 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 		 222 aa  224  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  47.71 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  47.71 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  47.51 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 269 aa  221  6e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  46.95 
 
 		 221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 245 aa  218  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  49.78 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  49.35 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  49.34 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 		 221 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  52.4 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  47.47 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 216 aa  208  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 		 231 aa  207  8e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  49.06 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  48.97 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  48.13 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  47.17 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8763  predicted protein  49.78 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00281165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 226 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 301 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  47.44 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 304 aa  198  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>