240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3854 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  86.09 
 
 
232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  66.37 
 
 
228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 
245 aa  236  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
225 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
221 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
225 aa  228  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
221 aa  227  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
225 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 
225 aa  224  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
221 aa  224  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
225 aa  225  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
225 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
225 aa  224  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 
225 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 
225 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  47.95 
 
 
225 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 
225 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
221 aa  221  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.3 
 
 
225 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
224 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 
225 aa  218  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
229 aa  217  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  47.89 
 
 
226 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 
222 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  51.17 
 
 
225 aa  214  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  47.51 
 
 
247 aa  214  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  47.49 
 
 
245 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 
224 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 
229 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
216 aa  209  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
225 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  48.89 
 
 
227 aa  208  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 
225 aa  207  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
241 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 
269 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
221 aa  205  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 
223 aa  205  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
231 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45.91 
 
 
223 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
231 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 
226 aa  204  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  51.54 
 
 
256 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 
268 aa  204  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
233 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
222 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8763  predicted protein  49.34 
 
 
230 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00281165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  47.64 
 
 
240 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
217 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
243 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  48.43 
 
 
235 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  43.32 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  48.91 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  48.42 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  48.37 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  49.28 
 
 
218 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
230 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 
253 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  45.66 
 
 
225 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  48.37 
 
 
231 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
216 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  47.93 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
279 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  47.71 
 
 
233 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
227 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  51.12 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
305 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
305 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
308 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  46.51 
 
 
223 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
263 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  49.53 
 
 
229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 
230 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 
301 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
262 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
262 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
228 aa  194  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
271 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
304 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  49.56 
 
 
263 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 
230 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  45.54 
 
 
217 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>