238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3371 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  90.62 
 
 		 229 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  73.42 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  70.4 
 
 		 225 aa  342  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  69.96 
 
 		 225 aa  338  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  335  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  333  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  69.37 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  331  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  331  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  69.82 
 
 		 225 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  69.82 
 
 		 225 aa  327  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  69.82 
 
 		 225 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  68.75 
 
 		 223 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  66.06 
 
 		 226 aa  305  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  63.11 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  60.73 
 
 		 229 aa  285  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  58.72 
 
 		 224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  60.19 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 223 aa  268  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  59.46 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  59.46 
 
 		 231 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  59.82 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  59.72 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  57.14 
 
 		 225 aa  264  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  57.99 
 
 		 231 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  59.17 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  60.73 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  58.45 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 226 aa  260  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  59.36 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  58.9 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  59.35 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  57.73 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  58.88 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  57.47 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  56.16 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  56.36 
 
 		 229 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  56.87 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  57.01 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  56.74 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  57.48 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  56.54 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  55.71 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  56.54 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  56.54 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  56.05 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  55.81 
 
 		 223 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  52.58 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  52.58 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  54.84 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 		 222 aa  244  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.31 
 
 		 222 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  57.01 
 
 		 227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  53.05 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  53.24 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  52.78 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  56.07 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 		 223 aa  239  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  50.92 
 
 		 222 aa  238  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  57 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  52 
 
 		 227 aa  236  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  53.28 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 		 245 aa  235  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  53.21 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>