240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3454 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  476  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  95.15 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  60.96 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  61.84 
 
 		 229 aa  291  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  60.96 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  58.33 
 
 		 232 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  59.47 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  58.15 
 
 		 231 aa  278  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  59.03 
 
 		 253 aa  278  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  59.65 
 
 		 241 aa  277  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  58.77 
 
 		 230 aa  277  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  58.15 
 
 		 230 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  59.21 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  58.15 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  58.33 
 
 		 230 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  57.76 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  60.85 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  58.3 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  61.16 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  55.46 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  56.05 
 
 		 222 aa  265  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  55.07 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  59.09 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  55.07 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  59.09 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 		 225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  58.14 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 221 aa  251  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  56.48 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  55.2 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  54.67 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  56.33 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  54.22 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  54.22 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  54.3 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 		 231 aa  241  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  54.38 
 
 		 221 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  56.11 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  51.83 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  51.34 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  51.34 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  51.83 
 
 		 222 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  53.33 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  51.54 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 222 aa  234  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  51.1 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  51.1 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  51.1 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  51.1 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  53 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 222 aa  231  8.000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  51.36 
 
 		 219 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 		 279 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 		 301 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  54.7 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 		 253 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  58.65 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>