237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0889 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
263 aa  517  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  75.21 
 
 
234 aa  317  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  61.95 
 
 
230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  56.83 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  61.67 
 
 
224 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  58.87 
 
 
238 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  60.79 
 
 
225 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  59.73 
 
 
223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  60.94 
 
 
231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 
227 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  60.35 
 
 
226 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  57.14 
 
 
225 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  57.58 
 
 
225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  58.37 
 
 
227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  58.37 
 
 
227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  58.37 
 
 
227 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  57.89 
 
 
225 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  57.14 
 
 
225 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  60.54 
 
 
230 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  62.45 
 
 
225 aa  255  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  55.84 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.02 
 
 
224 aa  248  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 
233 aa  248  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.11 
 
 
240 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  61.71 
 
 
259 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  57.27 
 
 
229 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  56.58 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  56.34 
 
 
213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  55.26 
 
 
225 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 
229 aa  234  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  57.51 
 
 
227 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.26 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  44.96 
 
 
232 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  46.19 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  43.91 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
269 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  40.95 
 
 
225 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  44.61 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 
225 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  41.92 
 
 
223 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 
225 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  47.44 
 
 
234 aa  168  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  41.33 
 
 
225 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  46.46 
 
 
226 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  41.33 
 
 
225 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
233 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  40.97 
 
 
226 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  45.24 
 
 
243 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  41.74 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.13 
 
 
218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  40.68 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  42.48 
 
 
235 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 
245 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  43.19 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  42.36 
 
 
230 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.87 
 
 
261 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  42.15 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 
230 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  43.33 
 
 
221 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  43.33 
 
 
221 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  43.67 
 
 
241 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  43.33 
 
 
221 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 
229 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  39.74 
 
 
231 aa  158  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  41.9 
 
 
221 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 
220 aa  158  8e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
234 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  38.94 
 
 
223 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 
229 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  43.19 
 
 
219 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  43.63 
 
 
220 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  41.07 
 
 
222 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  40.48 
 
 
225 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  39.15 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  39.91 
 
 
219 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 
231 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 
222 aa  155  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  45.97 
 
 
228 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  42.49 
 
 
226 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 
231 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 
253 aa  155  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  41.86 
 
 
222 aa  154  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  42.54 
 
 
241 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  45.26 
 
 
228 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  39.22 
 
 
226 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  41.43 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>