240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0362 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  61.4 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  57.02 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  62.44 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  56.19 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  56.64 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  56.64 
 
 		 232 aa  261  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  57.71 
 
 		 231 aa  258  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  57.71 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  53.28 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  52.86 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  55.95 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  56.19 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  56.19 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 231 aa  254  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 		 229 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  54.87 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 261 aa  248  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  56.19 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  55.75 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  54.63 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  57.47 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  53.98 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  55.56 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  55.25 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  54.46 
 
 		 269 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  56.68 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  57.6 
 
 		 228 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  54.71 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  57.6 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 225 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  57.6 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  55.51 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  54.15 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  56.02 
 
 		 228 aa  228  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  56.02 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  55.09 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 226 aa  224  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  52.21 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 		 229 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 222 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  49.1 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  50.89 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  51.39 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  51.36 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  50.46 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  51.82 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  48.85 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 245 aa  209  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>