237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0685 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
224 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  75.11 
 
 
226 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  73.87 
 
 
227 aa  320  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 
225 aa  312  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  67.86 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  67.87 
 
 
225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  64.71 
 
 
238 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  67.42 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  68.16 
 
 
223 aa  301  6.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  68.78 
 
 
225 aa  300  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  67.43 
 
 
230 aa  297  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  67.42 
 
 
231 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  62.9 
 
 
225 aa  291  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  65.45 
 
 
229 aa  290  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  67.12 
 
 
230 aa  288  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  63.84 
 
 
228 aa  288  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62.05 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  66.21 
 
 
229 aa  284  5.999999999999999e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  63.8 
 
 
225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  61.82 
 
 
233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  64.41 
 
 
227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  64.41 
 
 
227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  64.41 
 
 
227 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  68.18 
 
 
259 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  57.02 
 
 
238 aa  270  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  64.57 
 
 
227 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  64.38 
 
 
240 aa  260  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  61.67 
 
 
263 aa  258  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 
213 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  63.88 
 
 
234 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  60.18 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 
232 aa  209  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  48.33 
 
 
232 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 
225 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.11 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 
225 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 
225 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 
225 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  190  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 
229 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  46.22 
 
 
268 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 
269 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
225 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
226 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 
231 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 
225 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 
232 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 
225 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 
225 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.38 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 
229 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  40.91 
 
 
226 aa  177  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
223 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  43.38 
 
 
220 aa  176  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  45.73 
 
 
222 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 
243 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
224 aa  175  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  46.64 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  45.73 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 
247 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  46.83 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 
230 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  42.53 
 
 
230 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 
226 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 
228 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 
228 aa  170  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  47.6 
 
 
228 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  45.15 
 
 
253 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  40 
 
 
223 aa  169  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  44.66 
 
 
253 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  46.5 
 
 
231 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
230 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  43.43 
 
 
222 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  44.88 
 
 
241 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 
245 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  42.58 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  40.71 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  39.64 
 
 
244 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  43.2 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 
261 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  40.74 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  40.74 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  46 
 
 
229 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>