240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1403 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  77.53 
 
 		 228 aa  360  9e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  74.77 
 
 		 225 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  73.64 
 
 		 238 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  70.72 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  72.52 
 
 		 225 aa  327  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  69.2 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  70 
 
 		 225 aa  317  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  66.52 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  68.18 
 
 		 226 aa  304  8.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  68.92 
 
 		 231 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  66.22 
 
 		 225 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  67.12 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  65.02 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  66.08 
 
 		 229 aa  298  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  61.82 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  62.33 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  60.53 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  61.06 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  67.86 
 
 		 227 aa  278  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  61.67 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  63.47 
 
 		 230 aa  271  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  60.27 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  63.81 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  58.87 
 
 		 259 aa  258  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.31 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  57.8 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  57.08 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  55.31 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  49.32 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  44.64 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  45.09 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  47.11 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  48.29 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  48.9 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  44.2 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  50.24 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  47.21 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  44.02 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  48.17 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  43.38 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  43.5 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 241 aa  177  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  42.54 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  43.6 
 
 		 221 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  45.13 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  41.1 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  46.67 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  43.66 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  53.16 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  41.74 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  44.22 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  41.28 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  41.82 
 
 		 226 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  41.33 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  40.72 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 232 aa  171  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  44.5 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>