240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2138 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 222 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  62.5 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  53.27 
 
 		 234 aa  194  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  54.5 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  55.37 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.85 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  46.31 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  54.77 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  53.16 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.53 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  51.91 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  47.55 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.66 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  48.94 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  40.09 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  48.45 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  45.8 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  50.56 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  50.56 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  42.72 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  43 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  46.45 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  49.18 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  49.18 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  54.49 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  49.18 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  46.99 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  49.47 
 
 		 243 aa  174  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  46.99 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  51.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  51.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  48.91 
 
 		 233 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  51.4 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  47.6 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  47.6 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  42.79 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  43.06 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  49.16 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  52.36 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  48.28 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  48.89 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.84 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  46.39 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  47.78 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  47.78 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  52.36 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  47.78 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.61 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.69 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  49.73 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  52.6 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  51.67 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  46.96 
 
 		 301 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  51.6 
 
 		 256 aa  168  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.22 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  49.73 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 241 aa  167  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  46.31 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  45.85 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  48.04 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  51.34 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  47.35 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  47.35 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  47.35 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  48.63 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  46.07 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  40.89 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>