238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1473 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  99.15 
 
 		 234 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  92.27 
 
 		 234 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  68.72 
 
 		 234 aa  300  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  73.8 
 
 		 229 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  68.72 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  47.4 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  48.57 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  44.74 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  43.27 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  43.54 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.31 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  46.27 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  44.62 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  44.62 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  48.1 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  46.56 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  37.2 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  44.75 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  42.71 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  43.6 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  44.81 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  42.92 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  37.2 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  47.92 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  48.11 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  43.4 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  45.55 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  48.04 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  44.9 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  37.2 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  40.93 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  42.35 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  43.52 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  46.22 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  38.94 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  45.26 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.67 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  46.07 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.01 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  41.67 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  44.78 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  46.07 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  45.71 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  47.14 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  44.1 
 
 		 301 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  45.26 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  43.3 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  42.03 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  42.25 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  38.57 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  44.98 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  43.32 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  43.37 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  42.39 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  49.23 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  40.67 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.85 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  38.16 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  45.65 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  44.92 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  45.32 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  45.71 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  41.97 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  39.05 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  45.71 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  43.88 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>