238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0733 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 		 229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  73.8 
 
 		 234 aa  317  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  73.8 
 
 		 234 aa  317  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  74.12 
 
 		 234 aa  314  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  67.4 
 
 		 234 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  67.53 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  47.62 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  43.65 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  46.84 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  48.94 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  40.76 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  47.85 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  44.68 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  47.15 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  44.02 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  43.83 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  44.9 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  45.32 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  42.24 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  50.99 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  48.45 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  44.86 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  41.58 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  44.86 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.01 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.01 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  39.52 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  41.83 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  47.4 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  46.56 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3875  uracil-DNA glycosylase  45.38 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  41.83 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  46.32 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  40.31 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  40.31 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  44.32 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 268 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  46.32 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  42.34 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  41.83 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  41.94 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  46.95 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  45.08 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  45.13 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  46.95 
 
 		 304 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  42.34 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  44.85 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  43.83 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  47.57 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  41.4 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  43.08 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  45.07 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  46.2 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  42.31 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.86 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  40.31 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  44.68 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  42.64 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  46.95 
 
 		 301 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  48.45 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  41.35 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  41.35 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  41.35 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  41.35 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  41.06 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  40.48 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  39.13 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  42.16 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  44.26 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>