238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0514 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 		 329 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  49.12 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  55.44 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  49.12 
 
 		 231 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  55.96 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  52.5 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  55.44 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  52 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  51.13 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  54.36 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  54.87 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  52.45 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  51.69 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  51.21 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  51.21 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  51.21 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  51.21 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  48.33 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  51.2 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  50.73 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  54.08 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  51.3 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  52.12 
 
 		 255 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  47.85 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  51.96 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  47.88 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  47.88 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  45.78 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2887  uracil-DNA glycosylase  49.58 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3129  uracil-DNA glycosylase  49.36 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  50.78 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2764  uracil-DNA glycosylase  49.36 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  45.63 
 
 		 216 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 221 aa  198  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  50.42 
 
 		 256 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0501  uracil-DNA glycosylase  51.52 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2576  uracil-DNA glycosylase  51.52 
 
 		 305 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 		 301 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0529  uracil-DNA glycosylase  51.52 
 
 		 305 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  50.65 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  45.41 
 
 		 220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  53.27 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  47.79 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  50.86 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  48.1 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  47.79 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  47.79 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  49.48 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 262 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 262 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 223 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 		 304 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.89 
 
 		 222 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  50.21 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  45.05 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  50.43 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  49.22 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  48.51 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  51.3 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  47.14 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3616  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  46.83 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  43.64 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>