238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0224 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  56.25 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  51.14 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  52.85 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  54.64 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  54.64 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  56.02 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  55.19 
 
 		 241 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  56.54 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  52.36 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.76 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  53.54 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.6 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  53.44 
 
 		 221 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 230 aa  204  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  51.89 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  50.53 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  53.44 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  53.44 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  51.58 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  53.44 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  54.35 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.48 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  53.26 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  52.97 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  48.98 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  50.54 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  53.72 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  50.52 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  52.82 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.8 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  48.26 
 
 		 216 aa  201  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  46.48 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  52.46 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  52.79 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  52.72 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  48.95 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  53.03 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  52.5 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 		 229 aa  197  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  52.53 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  53.01 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  50.54 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  53.8 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  55.32 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  53.26 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  49.48 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  46.98 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 		 269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  49.49 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  50.75 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 271 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  46.84 
 
 		 329 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  51.52 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  50.27 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 262 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 262 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  46.94 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  51.78 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  51.89 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  50.27 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  52.72 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  54.26 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  46.01 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>