238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4644 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 234 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  85.47 
 
 		 234 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  68.72 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  68.28 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  68.28 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.53 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  48.88 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  43.48 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  45.24 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  49.74 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  48.02 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  46.38 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  47.96 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  53.74 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  47.64 
 
 		 269 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.85 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  43.96 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  51.87 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  46.27 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.27 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  46.24 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  48.44 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  46.67 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  46.01 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  44.71 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  48.21 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  47.89 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  42.51 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  49 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  47.92 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  46.91 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  42.31 
 
 		 222 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  40.99 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  50.79 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  43.04 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  45.11 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  45.65 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  41.9 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  46.28 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  42.23 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  43.88 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  44.15 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  42.42 
 
 		 216 aa  178  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45.23 
 
 		 237 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  43.84 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  40.87 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  42.45 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  49.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  42.47 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  43.55 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.13 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  42.79 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  41.98 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3183  uracil-DNA glycosylase  48.6 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.315974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.73 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  42.11 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3028  uracil-DNA glycosylase  45.87 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0789088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  44.33 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  44.71 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  43 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  42.33 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  41.79 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>