238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2583 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2583  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4644  uracil-DNA glycosylase  85.47 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1473  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  68.72 
 
 		 234 aa  300  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.422171  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  68.28 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  68.28 
 
 		 234 aa  296  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0733  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.4 
 
 		 229 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  49.21 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  49.28 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  49.75 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  45.93 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  43.81 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  52.08 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  46.53 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  44.93 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  47.34 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  47.72 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  45.45 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  44.78 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  46.38 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  42.63 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  50.27 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.23 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  51.87 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  47.94 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.6 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  42.63 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  42.63 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  45.18 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  43.27 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  41.06 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  42.63 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  46.39 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  41.83 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  46.63 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  43.39 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44.32 
 
 		 226 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  45.95 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  41.83 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  50.79 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.57 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  45.19 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  45.93 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  42.72 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  43.08 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  42.57 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  46.88 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  44.32 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  45.95 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  40.19 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  45.92 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  41.75 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  45.95 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  41.43 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  43.62 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  49.25 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 230 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  41.24 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  45.13 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  41.3 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  43.96 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  44.72 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>