240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0239 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0239  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.322899  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  56.36 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 226 aa  228  7e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  49.31 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  45.79 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  46.76 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  45.41 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  45.62 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  49.07 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  46.79 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  47.44 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  46.98 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  46.05 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 226 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  44.95 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  45.87 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  44.04 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  47.66 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  46.3 
 
 		 229 aa  187  7e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  45.12 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  46.51 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  42.99 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 219 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  43.38 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  46.26 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  43.44 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  44.65 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  44.65 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  42.66 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  46.51 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  47.42 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  43.58 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  45.87 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  43.26 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 261 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  46.12 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  44.91 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  44.7 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  44.24 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  43.72 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  44.39 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  43.52 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  42.86 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  43.98 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>