240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1622 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  77.48 
 
 
228 aa  362  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  77.33 
 
 
238 aa  362  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  77.33 
 
 
225 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  73.33 
 
 
225 aa  349  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  74.77 
 
 
233 aa  346  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  74.67 
 
 
231 aa  337  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  68.89 
 
 
225 aa  328  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  69.78 
 
 
225 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  70.48 
 
 
227 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  70.48 
 
 
227 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  70.48 
 
 
227 aa  327  9e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  70.85 
 
 
224 aa  325  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 
225 aa  324  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  68.33 
 
 
227 aa  311  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  73.13 
 
 
227 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  68.33 
 
 
226 aa  309  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  68.33 
 
 
229 aa  308  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  68.64 
 
 
223 aa  308  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  66.06 
 
 
225 aa  301  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  65.14 
 
 
230 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  67.12 
 
 
229 aa  295  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  62.9 
 
 
224 aa  291  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  67.45 
 
 
230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  64.76 
 
 
213 aa  274  7e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  59.03 
 
 
238 aa  274  9e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  60.36 
 
 
259 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  63.2 
 
 
234 aa  257  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  56.88 
 
 
225 aa  244  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  57.58 
 
 
263 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.81 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  50.65 
 
 
232 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  48.89 
 
 
229 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 
232 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  46.12 
 
 
269 aa  189  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 
231 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
228 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 
231 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 
232 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  46.67 
 
 
268 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  42.67 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  43.56 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  46.64 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  45.5 
 
 
225 aa  181  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  44.59 
 
 
225 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  45.83 
 
 
226 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
224 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
229 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 
230 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  46.57 
 
 
218 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  46.94 
 
 
223 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  43.11 
 
 
225 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
230 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
229 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  44.34 
 
 
230 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  44.8 
 
 
230 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  45.25 
 
 
241 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  45.33 
 
 
225 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  46.7 
 
 
226 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  44.09 
 
 
224 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  46.58 
 
 
222 aa  175  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  47.69 
 
 
216 aa  175  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 
225 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  43.95 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  43.95 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  46.46 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  43.89 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  41.63 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 
261 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  49.21 
 
 
234 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  42.47 
 
 
221 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  43.93 
 
 
218 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  45.19 
 
 
220 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  43.93 
 
 
218 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  45.85 
 
 
237 aa  167  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  48 
 
 
217 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 
230 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  43.58 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  42.22 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  43.46 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  41.1 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  47.72 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  48.48 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  47.45 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  44.5 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  40.95 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 
253 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>