237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0474 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0474  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
218 aa  429  1e-119  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl243  uracil-DNA glycosylase  57.21 
 
 
216 aa  244  6.999999999999999e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  42.08 
 
 
228 aa  177  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  42.57 
 
 
225 aa  177  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  41.74 
 
 
220 aa  175  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  43.07 
 
 
225 aa  173  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  41.62 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  39.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  39.7 
 
 
233 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  39.64 
 
 
223 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  40.39 
 
 
222 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  38.12 
 
 
225 aa  168  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  41.29 
 
 
228 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  41.29 
 
 
228 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  39.46 
 
 
226 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  40.1 
 
 
229 aa  166  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  39.37 
 
 
226 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  43.75 
 
 
225 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  39.82 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1436  Uracil-DNA glycosylase  40.38 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.910626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  35.56 
 
 
253 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  45.16 
 
 
225 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  44.32 
 
 
225 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  41.62 
 
 
226 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  41.47 
 
 
221 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  40.37 
 
 
224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  39.6 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  38.81 
 
 
227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0456  uracil-DNA glycosylase  35.56 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  39.9 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  39.6 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  39.6 
 
 
225 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  37.27 
 
 
241 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  36.77 
 
 
228 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  39.07 
 
 
218 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  38.91 
 
 
222 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  39.07 
 
 
218 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  36.28 
 
 
245 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  40.7 
 
 
225 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  34.4 
 
 
225 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  33.64 
 
 
235 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  38.43 
 
 
225 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  34.39 
 
 
259 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  42.35 
 
 
229 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  39.7 
 
 
225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  42.78 
 
 
228 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  42 
 
 
229 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  37.62 
 
 
232 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  35 
 
 
233 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  42 
 
 
229 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  43.78 
 
 
221 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  42 
 
 
229 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  42.27 
 
 
228 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  39.11 
 
 
225 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  39.11 
 
 
225 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  39.11 
 
 
225 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  38.81 
 
 
221 aa  158  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  42.78 
 
 
228 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  43.14 
 
 
222 aa  157  8e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  32.44 
 
 
271 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  37.44 
 
 
223 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  38.92 
 
 
223 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  36.36 
 
 
237 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  38.61 
 
 
226 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
229 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
229 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  41.5 
 
 
229 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
229 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  38.18 
 
 
224 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
229 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  39.23 
 
 
245 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  43.15 
 
 
222 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  38.61 
 
 
225 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  41.5 
 
 
229 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  38.89 
 
 
217 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0224  uracil-DNA glycosylase  38.27 
 
 
211 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 
221 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  35.29 
 
 
233 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  42.05 
 
 
216 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  38.61 
 
 
229 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 
221 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  35.5 
 
 
241 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 
221 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  37.44 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  43.24 
 
 
235 aa  155  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  41.94 
 
 
225 aa  155  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  41.08 
 
 
223 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  32 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  32 
 
 
262 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  39.63 
 
 
229 aa  155  7e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  35.96 
 
 
221 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  37.44 
 
 
221 aa  154  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  37.05 
 
 
261 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  36.71 
 
 
221 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  36.63 
 
 
225 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  35.96 
 
 
218 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  40.72 
 
 
230 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  38.76 
 
 
269 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>