238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2017 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2017  Uracil DNA glycosylase-like protein  100 
 
 
551 aa  1105    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0949  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.99 
 
 
537 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  29.09 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  29.36 
 
 
229 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  31.6 
 
 
231 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  29.36 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  31.6 
 
 
231 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  31.6 
 
 
231 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  28.7 
 
 
230 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  29.36 
 
 
231 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  29.57 
 
 
230 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  29.63 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  23.77 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  27.68 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  28.26 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  29.17 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  25.31 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  25.56 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  29.58 
 
 
218 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  29.58 
 
 
218 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  28.18 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  28.21 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  24.53 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  25.71 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  30.33 
 
 
224 aa  77  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  28.72 
 
 
216 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  28.9 
 
 
232 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  32.29 
 
 
231 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  23.33 
 
 
225 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2541  uracil-DNA glycosylase  23.15 
 
 
329 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0587  uracil-DNA glycosylase  26.82 
 
 
241 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  25.12 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  27.52 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1846  uracil-DNA glycosylase  26.7 
 
 
240 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963093  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  26.05 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  27.73 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  30.88 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  30.53 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  23.89 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  27.31 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  27.01 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  22.83 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  30 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  27.44 
 
 
225 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  28.7 
 
 
225 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  26.91 
 
 
225 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  24.6 
 
 
247 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  29.02 
 
 
225 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  26.91 
 
 
225 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  26.91 
 
 
225 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  23.39 
 
 
231 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3600  uracil-DNA glycosylase  24.05 
 
 
250 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0245858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  30.73 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  25.98 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  25.32 
 
 
241 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  21.17 
 
 
227 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  26.75 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  30.33 
 
 
235 aa  72  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  29.13 
 
 
220 aa  72  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  21.17 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  22.73 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0514  uracil-DNA glycosylase  23.04 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  30.73 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  28.25 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  23.53 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  26.56 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  29.12 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  26.56 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  29.12 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  27.85 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  24 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  31.77 
 
 
223 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2929  uracil-DNA glycosylase  27.66 
 
 
219 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000416129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0580  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
239 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  27.62 
 
 
225 aa  70.1  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  24.53 
 
 
225 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  29.28 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  27.8 
 
 
226 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  25.39 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  28.57 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  22.97 
 
 
227 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0773  uracil-DNA glycosylase  24.88 
 
 
274 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.878372  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  29.17 
 
 
220 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  28.26 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  22.97 
 
 
227 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1473  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.38 
 
 
234 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.113143 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  27.14 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  22.97 
 
 
227 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  24.14 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  26.05 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1751  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.9 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.587538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  26.89 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  27.51 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  26.09 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  27.98 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4450  uracil-DNA glycosylase  24.77 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0313776  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  25.35 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  25.68 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  24.26 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>