More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3669 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3669  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3792  LysR family transcriptional regulator  97.97 
 
 		 295 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0791  LysR family transcriptional regulator  68.73 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0658  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.45 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 297 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 350 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2140  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.747614  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3957  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.770082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002880  putative transcriptional regulator LysR family  26.52 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03092  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1239  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4311  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6471  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2478  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.695229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4009  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4471  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190503  normal  0.801309 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4540  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799162  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3468  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  32.61 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0588  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  32.95 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  29.07 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  32.66 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2207  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1081  transcriptional regulator AphB  26.43 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7497  transcriptional regulator LysR family  28.83 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3567  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.346329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  29.64 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3963  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5503  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3456  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.695325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2294  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3391  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4063  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.02 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0567  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  29.47 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4303  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>