More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1430 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2924  transcriptional regulator, LysR family  99.68 
 
 		 313 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1460  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1424  LysR family transcriptional regulator  98.72 
 
 		 313 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1430  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1607  LysR family transcriptional regulator  93.51 
 
 		 314 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3183  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 302 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3301  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 302 aa  328  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000341492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2903  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3182  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1247  transcriptional regulator, LysR family protein  43.93 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1727  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.986753  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000302  transcriptional regulator LysR family  31.25 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0561  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3392  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3562  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0310  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000312  transcriptional regulator LysR family  28.32 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0124  leucine transcriptional activator  28.28 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.442889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0127  leucine transcriptional activator  28.28 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0126  leucine transcriptional activator  28.28 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  hitchhiker  0.00376656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0131  leucine transcriptional activator  28.28 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0131  leucine transcriptional activator  28.28 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0678941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2749  leucine transcriptional activator  30.07 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00078  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3523  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0078  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0081  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.669516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0081  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3581  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.000946626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0084  leucine transcriptional activator  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00077  hypothetical protein  26.94 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0746  leucine transcriptional activator  26.8 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2748  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.388713  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000894  transcriptional regulator LysR family  27.67 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001651  transcriptional regulator LysR family  30.29 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0623  leucine transcriptional activator  25.67 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0252202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00823  leucine transcriptional activator  30.49 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  27.67 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2061  leucine transcriptional activator  30.2 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  27.89 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3533  leucine transcriptional activator  26.26 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3403  leucine transcriptional activator  26.26 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2934  leucine transcriptional activator  26 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.594963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.19 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1282  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.526163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0069  leucine transcriptional activator  26.6 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  25.23 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  26.52 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2308  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  26.9 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  24.76 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  26.17 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  25.57 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1897  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0520736  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  23.59 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  26.26 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  25.31 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>