More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0661 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0661  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0495  hypothetical protein  53.43 
 
 
278 aa  296  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1527  sugar kinase  49.82 
 
 
273 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1292  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.82 
 
 
286 aa  242  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0658  sugar kinase  44.6 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.809814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  45.83 
 
 
271 aa  233  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  48.75 
 
 
275 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0007  hypothetical protein  45.49 
 
 
270 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0007  hypothetical protein  45.49 
 
 
270 aa  232  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0463  sugar kinase  42.81 
 
 
286 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.787563 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.8 
 
 
492 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  35.29 
 
 
496 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.38 
 
 
492 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  32.09 
 
 
496 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  35.63 
 
 
496 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.86 
 
 
499 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.86 
 
 
499 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.86 
 
 
499 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  31.18 
 
 
499 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 
499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.57 
 
 
488 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  32.26 
 
 
499 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
499 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.68 
 
 
496 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
494 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
492 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 
494 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  31.44 
 
 
496 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  31.84 
 
 
511 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.11 
 
 
314 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 
286 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 
494 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.45 
 
 
504 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 
307 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  37.25 
 
 
488 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  37.25 
 
 
486 aa  122  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.45 
 
 
504 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.28 
 
 
494 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  37.14 
 
 
510 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.09 
 
 
504 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.51 
 
 
502 aa  119  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  35.29 
 
 
490 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.87 
 
 
307 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  36.84 
 
 
514 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  33.77 
 
 
499 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  33.46 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  33.46 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  33.46 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  37.4 
 
 
462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.48 
 
 
492 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  34.39 
 
 
502 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  33.46 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  33.46 
 
 
514 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.84 
 
 
286 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  34.41 
 
 
510 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  33.07 
 
 
494 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 
499 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  36.11 
 
 
495 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.48 
 
 
503 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  33.33 
 
 
515 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.09 
 
 
492 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  33.33 
 
 
515 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  33.21 
 
 
493 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.46 
 
 
508 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  36.55 
 
 
513 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.6 
 
 
515 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.93 
 
 
515 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30 
 
 
502 aa  109  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  33.6 
 
 
510 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  33.6 
 
 
510 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.93 
 
 
515 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  35.74 
 
 
436 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  33.21 
 
 
493 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.6 
 
 
509 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.23 
 
 
498 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.59 
 
 
494 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  33.2 
 
 
515 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.82 
 
 
500 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.95 
 
 
512 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  33.85 
 
 
499 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
520 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
490 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.36 
 
 
499 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  31.16 
 
 
513 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
487 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.43 
 
 
511 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.13 
 
 
546 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  30.63 
 
 
512 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  31.43 
 
 
498 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.62 
 
 
509 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.43 
 
 
501 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.31 
 
 
515 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  33.06 
 
 
524 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  32.07 
 
 
517 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.74 
 
 
390 aa  99  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  30.74 
 
 
512 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.47 
 
 
504 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  30.91 
 
 
502 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0520  hypothetical protein  33.61 
 
 
586 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75104  decreased coverage  0.0023767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>