More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0978 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  100 
 
 		 391 aa  799    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  81.84 
 
 		 391 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  89.51 
 
 		 396 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  90.28 
 
 		 396 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  81.33 
 
 		 391 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  90.28 
 
 		 396 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  81.33 
 
 		 391 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  81.33 
 
 		 391 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  81.33 
 
 		 391 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  62.91 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  62.56 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.75 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  62.82 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  57.91 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 436 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 545 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 543 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 522 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.06 
 
 		 495 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.01 
 
 		 557 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 530 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 537 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.04 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.41 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 537 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.42 
 
 		 489 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 567 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.08 
 
 		 526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.43 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.66 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 528 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 533 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 		 509 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 539 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 502 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 		 503 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 555 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.01 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.87 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.83 
 
 		 509 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.69 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.72 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 548 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.87 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 562 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.98 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.99 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.04 
 
 		 510 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 		 519 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.7 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.82 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.23 
 
 		 526 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.93 
 
 		 510 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.61 
 
 		 547 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.44 
 
 		 502 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.42 
 
 		 511 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.61 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.72 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.17 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.19 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 520 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.2 
 
 		 513 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.71 
 
 		 526 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 		 513 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 543 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.82 
 
 		 502 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.93 
 
 		 513 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.6 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.05 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.33 
 
 		 510 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.17 
 
 		 582 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.74 
 
 		 502 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.42 
 
 		 525 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.41 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 526 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>