More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0629 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 404 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  62.73 
 
 		 391 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  62.47 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  63 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  61.93 
 
 		 391 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  61.66 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  60.86 
 
 		 391 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  61.39 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  60.59 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  58.97 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  58.21 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 543 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 556 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 550 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 545 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 552 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 528 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 536 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.68 
 
 		 557 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 537 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.42 
 
 		 495 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 		 537 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.42 
 
 		 551 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 548 aa  163  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 527 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 555 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 532 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.24 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 546 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.19 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.12 
 
 		 530 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 532 aa  159  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.96 
 
 		 512 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 532 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 582 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  30.26 
 
 		 543 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.66 
 
 		 507 aa  156  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.56 
 
 		 526 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 536 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.94 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 529 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.39 
 
 		 526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.65 
 
 		 557 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 519 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 502 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 543 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.65 
 
 		 573 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.45 
 
 		 502 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.15 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 557 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 567 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 499 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.2 
 
 		 557 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.48 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.48 
 
 		 506 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  32.49 
 
 		 545 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.54 
 
 		 582 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.9 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 547 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.18 
 
 		 502 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34 
 
 		 532 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 585 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 546 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.84 
 
 		 529 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 518 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.35 
 
 		 489 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 582 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.24 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.77 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.68 
 
 		 496 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 575 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.8 
 
 		 547 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.99 
 
 		 512 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 600 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.83 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  29.2 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.87 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  29.2 
 
 		 560 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>