More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0595 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  70.91 
 
 
523 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
551 aa  1134    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 
532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.48 
 
 
526 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
546 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
527 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
551 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
523 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
526 aa  326  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.96 
 
 
461 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
554 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
603 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
534 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
528 aa  209  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.05 
 
 
585 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
537 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
546 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
530 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  29.38 
 
 
700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
546 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
582 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  33.89 
 
 
543 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.34 
 
 
557 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
564 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.55 
 
 
573 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  28.27 
 
 
545 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
554 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
557 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
539 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.29 
 
 
591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
525 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.93 
 
 
525 aa  189  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
600 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
566 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.17 
 
 
560 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.35 
 
 
560 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.35 
 
 
560 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.35 
 
 
560 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.35 
 
 
560 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
550 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.89 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.07 
 
 
560 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
532 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
532 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.07 
 
 
560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.89 
 
 
560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
574 aa  183  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
540 aa  183  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
559 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
557 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
573 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
518 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
548 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
582 aa  181  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
582 aa  180  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 
567 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
542 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  38.13 
 
 
520 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.24 
 
 
532 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.1 
 
 
520 aa  179  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
569 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
552 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 
529 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
579 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
603 aa  173  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
519 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 
556 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
576 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.58 
 
 
581 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  28.21 
 
 
559 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
508 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
559 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
579 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.37 
 
 
502 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.17 
 
 
567 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
577 aa  171  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.94 
 
 
502 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
522 aa  170  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
543 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  30.28 
 
 
517 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
575 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
519 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.11 
 
 
502 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.7 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
639 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.64 
 
 
582 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
523 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.34 
 
 
506 aa  167  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
519 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>