More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
461 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  94.35 
 
 
526 aa  816    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  72.39 
 
 
523 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 
532 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 
546 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  45.25 
 
 
551 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 
527 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 
526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 
551 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
523 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
579 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
567 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
557 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
554 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
569 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
582 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
600 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
573 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.36 
 
 
567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.12 
 
 
525 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 
583 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 
552 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
528 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.2 
 
 
591 aa  183  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
532 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
578 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 
545 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
532 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
579 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 
554 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
546 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.39 
 
 
587 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.43 
 
 
530 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
576 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  31.93 
 
 
585 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
564 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
579 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
579 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
519 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
575 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
579 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
583 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
585 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
603 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
584 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
536 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
568 aa  173  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
582 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
574 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
573 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.02 
 
 
585 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
557 aa  171  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.28 
 
 
557 aa  169  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
582 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
518 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
639 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
582 aa  166  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
574 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 
560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
552 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 
605 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
581 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.23 
 
 
560 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
524 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.23 
 
 
560 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.23 
 
 
560 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
595 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.81 
 
 
513 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.56 
 
 
517 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
560 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.8 
 
 
515 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  26.95 
 
 
609 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
567 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  29.74 
 
 
602 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
556 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
603 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.7 
 
 
502 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.31 
 
 
551 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
542 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
560 aa  157  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
559 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
572 aa  156  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
519 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>