More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1559 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 523 aa  1038    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  73.51 
 
 		 526 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  72.39 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 		 546 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  50.8 
 
 		 532 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 527 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 		 526 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 551 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 523 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.53 
 
 		 530 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 582 aa  237  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 		 585 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.6 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 537 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 582 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 554 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 556 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 525 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 579 aa  226  7e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 603 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 600 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 536 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 545 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 540 aa  223  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.53 
 
 		 554 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 581 aa  220  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 585 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 573 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 557 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31 
 
 		 557 aa  217  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 524 aa  217  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.33 
 
 		 587 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 542 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  33.4 
 
 		 559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 582 aa  213  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  42.09 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 559 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 573 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 572 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  33 
 
 		 585 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 564 aa  210  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  30.68 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  31.47 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 575 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 546 aa  207  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 568 aa  206  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 582 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  31.82 
 
 		 602 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.9 
 
 		 591 aa  205  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 557 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 559 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 578 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 560 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.77 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  26.73 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.51 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.51 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.51 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.25 
 
 		 605 aa  198  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.51 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.51 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 		 560 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>