More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2133 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 526 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  73.51 
 
 		 523 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  94.35 
 
 		 461 aa  795    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 		 546 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 		 527 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  50.7 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  47.04 
 
 		 551 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 551 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 523 aa  332  9e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 579 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.14 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.24 
 
 		 530 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 567 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 540 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 532 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.17 
 
 		 591 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 600 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 579 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.41 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 582 aa  219  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.79 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 557 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.43 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 578 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.76 
 
 		 587 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 536 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 569 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 577 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 556 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 585 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 576 aa  214  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 573 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 575 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  28.46 
 
 		 520 aa  213  7e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 579 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 579 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 579 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.81 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  41.3 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 581 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 		 557 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 584 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 559 aa  210  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 537 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 579 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 543 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  33.8 
 
 		 585 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 524 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 560 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.13 
 
 		 554 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 564 aa  206  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 537 aa  203  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 568 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 572 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 560 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 639 aa  200  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  32.71 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 519 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.75 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 559 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 539 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.72 
 
 		 557 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.75 
 
 		 560 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 576 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>