More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0800 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0800  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 413 aa  841    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3425  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 391 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3055  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3497  FAD dependent oxidoreductase  58.71 
 
 		 391 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3620  FAD dependent oxidoreductase  57.91 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0867  FAD dependent oxidoreductase  58.45 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0935  FAD dependent oxidoreductase  61.28 
 
 		 391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0816  FAD dependent oxidoreductase  57.37 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3207  FAD dependent oxidoreductase  58.18 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.778755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0836  FAD dependent oxidoreductase  59.49 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0978  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase, family protein  57.91 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3310  FAD dependent oxidoreductase  57.64 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0752  FAD dependent oxidoreductase  59.23 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0629  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.8 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  52.12 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  43.77 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1482  Fis family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.775538  normal  0.852697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.53 
 
 		 557 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 545 aa  199  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 		 550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 556 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.99 
 
 		 502 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.75 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.73 
 
 		 502 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 522 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.46 
 
 		 502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 543 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 548 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 567 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.84 
 
 		 516 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.37 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 566 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 532 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.6 
 
 		 503 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.53 
 
 		 507 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 555 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.53 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.58 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.26 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.54 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.69 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.62 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.26 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.13 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.94 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.94 
 
 		 512 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.56 
 
 		 525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.57 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 514 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 		 510 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.88 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.5 
 
 		 509 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.52 
 
 		 502 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.56 
 
 		 525 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 533 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.15 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.88 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.69 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.34 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.73 
 
 		 525 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.77 
 
 		 510 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.71 
 
 		 517 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 		 530 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.77 
 
 		 507 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.52 
 
 		 506 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.34 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3524  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.63 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.78 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.47 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.47 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  31.62 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.47 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.82 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.98 
 
 		 504 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  36.58 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.58 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.58 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.58 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.68 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>